嘉義是 王創辨人的第二故鄉，於民國九十年12月王正儀院長銜命率領全體員工到朴子長庚醫院展開服務鄉梓之使命，一轉眼嘉長已進入第20年了。研究亦在歷任許文蔚院長及現任蔡熒煌院長支持與強力推動下，主治醫師研究計畫持有率成長至36%，長庚研究計畫經費成長32倍，研究計畫總件數成長4.7倍，除研究論文件數逐年成長外，品質也逐漸提昇。
嘉義長庚研究環境之建置，自91 年啟用共同實驗室(約100坪)至100年擴建搬遷增加至420 坪。92年設立腫瘤銀行，96 年爭取設立臨研所嘉義分班、正式啟用動物實驗大樓。這10 年期間，逐步建構基礎研究環境，91~95 年以鼓勵醫師研究、提升研究風氣為主，自96年起陸續推動整合型研究計畫，至102年已成功推動腦中風研究、腎臟暨糖尿病合併症研究、運動醫學研究、腫瘤分子標記臨床應用等研究團隊。由資深研究人員帶領，並以整合型研究計畫給予支持，提供人事及設備之經費，協助整合形成研究團隊，朝科研究中心之目標逐步邁進。
俾利確保實驗數據之正確性，提昇品質管理層次並與國際接軌，於97年起逐步導入國際認證作業。實驗動物中心於97年導入ISO 9001 品質管理認證，98年取得ISO 9001國際品質管理認證，103年取得AAALAC國際認證；貴重儀器：Tissue array、Flow Cytometer-Sorter、Confocal於100 年導入ISO 17025認證，102年取得ISO 17025認證。
嘉義院區研究推展重點與目標以重點扶持研究團隊、傑出研究人才延攬/研究人才之培育、塑造優質研究環境為三大努力方向。藉由重點研究團隊之扶持，延聘高階研究人才(PhD)、建置基礎研究平台，向下紮根，逐漸培養研究能量(圖一)。於研究人才之培育/延攬，除持續鼓勵主治醫師進修外，亦鼓勵醫師申請擔任醫師研究員。另院方亦積極延攬傑出研究人才(頂尖研究團隊)中，日後可結合長庚研究院之資源，達到向上拔尖之目標。
近五年之研究推動策略以建構優質大環境為主軸：(1)以40%研究人力為目標值(2)建置研究平台與提供技術支援(3)研究人才之經營。