病理科系於1986年1月長庚紀念醫院高雄分院開院時同時成立，下轄解剖病理科與臨床病理科，由陳維仁醫師及陳良醫師分別擔任科系主任和科主任籌備設立。
陳良醫師於2001年榮退，陳維仁醫師亦於2002年榮退轉任病理科顧問醫師。 2002年起由邢福柳醫師擔任科系主任兼臨床病理科主任；2009年起臨床病理科(Clinical Pathology)更名為檢驗醫學科(Laboratory Medicine)，2009年7月由宋明澤醫師擔任科主任；2015年7月起由黃琬婷醫師擔任科主任；2019年06月24日更名為｢檢驗醫學部｣。
組織沿革
•1996年7月起由邢福柳醫師擔任臨床病理科主任
•1996年吳姬戀醫檢師擔任技術主任
•2000年李佳縉醫檢師擔任技術主任
•2001年陳良醫師榮退
•2002年陳維仁醫師榮退轉任病理科顧問醫師
•2002年起由邢福柳醫師擔任科系主任兼臨床病理科主任
•2009年起臨床病理科( Clinical Pathology )更名為檢驗醫學科( Laboratory Medicine )
•2009年7月宋明澤醫師擔任科主任
•2012年尤慧玲醫檢師擔任醫檢主任
•2015年7月黃琬婷醫師擔任科主任
•2019年06月24日(108)院醫字第123號公告，修訂本科名稱為檢驗醫學部
•2022年7月張永達醫檢師擔任醫檢主任
未來發展與願景
建立全國性醫學檢驗諮詢實驗室為本部發展的目標，除開發各項特殊檢驗，增加臨床檢驗項目，並提供院內、院外的臨床檢驗諮詢服務作業。本部除了執行一般例行的檢驗項目外，並發展下列特色檢驗中心：
(一)病毒研究檢驗中心
快速病毒鑑定、病毒流行病學之研究
(二)分子生物檢驗中心
染色體檢驗實驗室。
傳染性疾病之診斷。
腫瘤之分子生物診斷。
個人化醫療基因篩檢。
(三)器官移植相關檢驗
細胞遺傳及染色體檢查。
病毒感染之分子生物診斷。
(四)質譜檢驗中心
移植免疫抑制藥物檢驗
環境荷爾蒙檢驗
品質管制~醫療品質監控系統
本部依據國際標準(Clinical and Laboratory Standards Institute；CLSI)規範，設有完整的檢驗品質管理系統，訂有品質手冊規範檢驗前、中、後相關品質要求並定期每月監控與持續改善服務水準，期望能提供病人最佳的檢驗服務品質，並透過品管圈(QCC)、根本原因分析(RCA)、醫療失效模式效應分析(HFMEA)等方法，持續提昇檢驗品質。
教育訓練
本部設有教學品管醫檢師，專責醫技學生實習教學。透過每週一次課室教學講解原理、分組實際操作、盲樣檢體實際操作並驗收學習成效。另安排參觀捐血中心、學術報告、與雙向座談會，以達到教師與學生雙向溝通之目的，提升醫技學生實習成效。
本部亦接受其他醫療院所人員代訓，增進醫事技術交流，提升中小醫院檢驗服務品質。我們亦十分重視醫檢師在職教育訓練，定期舉辦全部門性演講、各組研討會、臨床醫師教學、外賓演講等。我們也鼓勵醫檢人員參加院外的在職教育訓練或在職進修博碩士學位，以提升醫檢師臨床知識與研發能力。