嘉義長庚耳鼻喉頭頸外科自民國91年成立以來，積極提供雲嘉南地區民眾耳、鼻、喉、頭頸腫瘤各方面的診療。目前團隊共有十位主治醫師，其中兩位為醫學博士。本科研究動能在近幾年有顯著且持續地增長，至2022初，全科近五年共累積52篇國際級高品質論文（SCI）。此外，本科近幾年發展出多項特色醫療並有顯著成果。自2021年開始，本科升為系級，目前已經成為雲嘉南地區，耳鼻喉頭頸疾病的最主要治療中心。